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Compepitools

doi:10.18129/b9.bioc.compepitools

计算表观基因组学的工具

生物导体版本:版本(3.5)

开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。

作者:Kamal Kishore Mattia Pelizzola

维护者:kamal kishore

引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ compepitools”)

PDF R脚本 compepitools.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机
进口 AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB
链接
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
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源包 compepitools_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 compepitools_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) compepitools_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compepitools
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/
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