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生物导体版本:版本(3.5)
开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。
作者:Kamal Kishore Mattia Pelizzola
维护者:kamal kishore
引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)
):
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browsevignettes(“ compepitools”)
R脚本 | compepitools.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(3年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机 |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | compepitools_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | compepitools_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | compepitools_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compepitools |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/ |
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