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cobindR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cobindR
寻找转录因子结合位点的共现基序
Bioconductor版本:Release (3.5)
寻找并分析基因组中转录因子结合位点的共现基序
作者:Manuela Benary, Stefan Kroeger, Yuehien Lee, Robert Lehmann
维护者:Manuela Benary < Manuela。在cms.hu-berlin.de>
引用(从R中，输入引用(“cobindR”))：
安装
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##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("cobindR")
文档
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| R脚本 | 使用cobindR | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CellBiology，ChIPSeq，MultipleComparison，SequenceMatching，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 2.13 (R-3.0)(4年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | |
| 进口 | 方法,seqinr，yaml，rtfbs，gplots，mclust，gmp，BiocGenerics(> = 0.13.8),IRanges，Biostrings，BSgenome，biomaRt |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | rGADEM，seqLogo，genoPlotR平行,维恩图，RColorBrewer，vcd，MotifDb，降雪 |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | cobindR_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cobindR_1.14.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | cobindR_1.14.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/cobindR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cobindR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
