要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Comet”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

彗星

DOI:10.18129 / b9.bioc.comet.

Comet:区域外血杂项关联扫描(EWAS)结果和DNA共甲基化模式的可视化

Bioconductor版本:释放(3.5)

Ewas的可视化导致基因组区域。除了表型关联的P值,彗星还生成的共甲基化模式图和提供了一系列注释轨道。只要数据可以转化为基因组水平和任何物种,它就可以用于其他OMIC-宽关联扫描。

作者:Tiphaine C. Martin,Thomas Hardiman,Idil,TheI,Pei-Chien Tsai,Jordana T. Bell

维护者:Tiphaine Martin

引文(从R内,输入引文(“彗星”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Comet”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“彗星”)

PDF. r script. 彗星的用户指南
PDF. 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

Biocviews. chipseq.德甲基化dnaseq.差分甲基化ExoMeSeq.官能组学遗传学GenomeWideAssociation.Methylseq.甲基化阵列微阵列rnaseq.RiboSeq测序软件可视化
版本 1.8.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.1(R-3.2)(2.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R,网格,utils的,生物雕GVIZ.psychGGBIO.TrackViewer.
进口 Colortools.哈希,grdevices,格拉底rtracklayer.绞喉S4Vectors.Genomicranges.ggplot2.,统计,控制
链接到
建议 kn运行生物根系生物焦
系统要求
加强
URL. http://epigen.kcl.ac.uk/comet.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 comet_1.8.0.tar.gz.
Windows二进制文件 comet_1.8.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) comet_1.8.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/comet.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/comet/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网