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clustcomp
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doi：10.18129/b9.bioc.clustcomp
聚类比较软件包
生物导体版本：版本（3.5）
ClustComp是一个软件包，它实现了几种技术，用于比较和可视化不同聚类结果之间的关系，即平面与平面或分层与平面之间的关系。群集之间的这些关系使用加权双图显示，其中节点代表簇，边缘连接了与非空交点的节点对；每个边缘的重量是该相交中元素的数量，并通过边缘厚度显示。Barycentre算法提供了双图的最佳布局，该算法可最大程度地减少交叉数的加权数量。在比较层次结构和非层次聚类的情况下，树状图在不同的高度上修剪，通过通过深度优先搜索探索树，从根部开始。决定根据评分函数的值进行分割，该分支可以基于双图的美学或层次结构和平面聚类之间的相互信息。从两侧的一组簇之间的映射是用贪婪算法构造的，并且可以另外可视化。
作者：Aurora Torrente和Alvis Brazma。
维护者：aurora torrente
引用（从r内，输入引用（“ ClustComp”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ ClustComp”）
| R脚本 | ClustComp软件包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，基因表达，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.3） |
| 进口 | SM，统计，图形，grdevices |
| 链接 | |
| 建议 | 生物酶，，，，科隆卡，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | clustcomp_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | clustcomp_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | clustcomp_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clustcomp |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/clustcomp/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
