# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“chipseq”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipseq

为分析chipseq chipseq:一个包的数据

Bioconductor版本:版本(3.5)

工具帮助chipseq实验过程短的读取数据

作者:Deepayan Sarkar,罗伯特先生,迈克尔•劳伦斯Zizhen姚明

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

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文档

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browseVignettes (“chipseq”)

PDF	R脚本	一个示例ChIP-Seq分析工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,报道,DataImport,质量控制,测序,软件
版本	1.26.1
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 1.99.1),GenomicRanges(> = 1.17.7),ShortRead
进口	方法、统计数据晶格,BiocGenerics,IRanges,GenomicRanges,ShortRead
链接
建议	BSgenome,GenomicFeatures,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	平
进口我	ChIPQC,文案,HTSeqGenie,soGGi,transcriptR
建议我	GenoGAM,ggbio,oneChannelGUI
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chipseq_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	chipseq_1.26.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	chipseq_1.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseq/
包下载报告	下载数据