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DOI：10.18129 / b9.bioc.charm.

魅力微阵列的DNA甲基化数据分析

Bioconductor版本：释放（3.5）

该包实现了使用NimbleGM微阵列和MCRBC协议产生的DNA甲基化数据的分析工具。它在样品之间发现差异甲基化区域，计算甲基化估计百分比，包括阵列质量评估工具。

作者：马丁阿利，彼得穆卡卡马，哈里斯·贾菲德，拉斐尔伊顿

维护者：Peter Murakami

安装

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文件

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PDF.	r script.	魅力小插图
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	德甲基化那微阵列那软件
版本	2.22.0
在生物导体中以来	BIOC 2.6（R-2.11）（7.5岁）
执照	LGPL（> = 2）
依靠	r（> = 2.14.0），BioBase.那SQN.那领域那rcolorbrewer.那Genefilter.
进口	bsgenome.那BioBase.那oligo.（> = 1.11.31），oligoclasses.（> = 1.17.39），FF.那预处理核，方法，统计，生物仪器那绞喉那siggenes.那nor1mix那GTOOLS.，grdevices，图形，实用程序，林马， 平行，SVA.（> = 3.1.2）
链接到
建议	charmdata.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18那CORPCOR.
系统要求
加强
URL.
取决于我	charmdata.
进口我
建议我
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包档案包

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源包	charm_2.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	charm_2.22.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	charm_2.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/charm.
包短网址	http://biocidodder.org/packages/charm/
包裹下载报告	下载统计信息