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CCREPE

doi:10.18129/b9.bioc.ccrepe

ccrepe_and_nc.score

生物导体版本:版本(3.5)

CCREPE(由肾上腺素化和排列校正的组成性)旨在评估组成数据集中一般相似性度量的重要性。例如,在微生物丰度数据中,所有微生物的总丰度总和为一个。CCREPE旨在在将P值分配给微生物之间的相似性度量时考虑此约束。该软件包具有两个函数:CCREPE:计算使用引导程序和数据的置换矩阵在一个或两个身体位点相对丰度的相似性度量,p值和Q值。NC.Score:根据棋盘得分扩展到序数数据,计算物种级的共同变异和共排除模式。

作者:Emma Schwager ,craig bielski ,george weingart >

维护者:gmail.com>> emma schwager ,craig bielski ,george weingart

引用(从r内,输入引用(“ ccrepe”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ ccrepe”)

PDF R脚本 CCREPE
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 生物信息学,,,,宏基因组学,,,,软件,,,,统计数据
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(3。5年)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看
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建议 尼特,,,,生物使用,,,,生物基因,,,,测试
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源包 ccrepe_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 ccrepe_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ccrepe_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccrepe
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ccrepe/
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