安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“biomvRCNS”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
在这个包中,一个隐藏的半马尔可夫模型(软件)和一个均匀细分模型设计和实现分割基因组数据,目的是协助记录检测使用高通量技术如RNA-seq或瓷砖数组,并使用aCGH或序列拷贝数分析。
作者:杨杜
维护人员:杨Du < tooyoung gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“biomvRCNS”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“biomvRCNS”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“biomvRCNS”)
R脚本 | biomvRCNS方案介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,遗传学,微阵列,测序,软件,可视化,aCGH |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | IRanges,GenomicRanges,Gviz |
进口 | 方法,mvtnorm |
链接 | |
建议 | 集群平行,GenomicFeatures,dynamicTreeCut,Rsamtools,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | biomvRCNS_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | biomvRCNS_1.16.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | biomvRCNS_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomvRCNS |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/ |
包下载报告 | 下载数据 |