要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("alpine")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

高山

Bioconductor版本:Release (3.5)

RNA-seq转录本丰度估计的片段序列偏差建模和校正。

作者:Michael Love, Rafael Irizarry

维护者:Michael Love

引用(从R中,输入引用(“高山”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("alpine")

文档

超文本标记语言 R脚本 高山
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingBatchEffect报道DifferentialSplicingGeneExpression归一化质量控制RNASeq测序软件转录可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor公司 BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.3)
进口 BiostringsIRangesGenomicRangesGenomicAlignmentsRsamtoolsSummarizedExperimentGenomicFeaturesspeedglm样条函数,RBGLstringr,统计,方法,图形,GenomeInfoDbS4Vectors
链接
建议 knitrtestthatalpineDatartracklayerensembldbBSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 alpine_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 alpine_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) alpine_1.2.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网