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Titancna

doi:10.18129/b9.bioc.titancna

从肿瘤的整个基因组测序中的亚克隆拷贝数和LOH预测

生物导体版本:版本(3.5)

隐藏的马尔可夫模型以细分和预测亚克隆拷贝数改变(CNA)和杂合性丧失(LOH)的区域,并估计肿瘤整个基因组测序数据中克隆簇的细胞cluronece。

作者:Gavin HA,Sohrab P Shah

维护者:broadinstitute.org>的gavin ha

引用(从r内,输入引用(“ titancna”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ titancna”)

PDF R脚本 Titancna
PDF 参考手册
文本 读书我

细节

生物浏览 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,遗传学,,,,基因组变量,,,,HiddenMarkovModel,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,全媒体
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(3。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.2.0),foreach(> = 1.4.2),iranges(> = 2.2.4),基因组机(> = 1.20.5),rsamtools(> = 1.20.4),GenomeInfodB(> = 1.4.0)
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源包 titancna_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 titancna_1.14.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) titancna_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/titancna
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/titancna/
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