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生物导体版本:版本(3.5)
隐藏的马尔可夫模型以细分和预测亚克隆拷贝数改变(CNA)和杂合性丧失(LOH)的区域,并估计肿瘤整个基因组测序数据中克隆簇的细胞cluronece。
作者:Gavin HA,Sohrab P Shah
维护者:broadinstitute.org>的gavin ha
引用(从r内,输入引用(“ titancna”)
):
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Browsevignettes(“ titancna”)
R脚本 | Titancna | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 |
生物浏览 | 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,遗传学,,,,基因组变量,,,,HiddenMarkovModel,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,全媒体 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(3。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.2.0),foreach(> = 1.4.2),iranges(> = 2.2.4),基因组机(> = 1.20.5),rsamtools(> = 1.20.4),GenomeInfodB(> = 1.4.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/gavinha/titancna |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | titancna_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | titancna_1.14.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | titancna_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/titancna |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/titancna/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |