要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TIN”)
在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
锡
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DOI:10.18129 / B9.bioc.TIN
转录组不稳定性分析
Bioconductor版本:Release (3.5)
TIN包实现了一套基于外显子表达谱的转录组不稳定性分析工具。在剪接因子的背景下研究外显子使用的偏差，以分析转录组不稳定性与剪接因子表达的相关程度。在转录组不稳定性相关分析中，将数据与选择性剪接得分的随机排列和随机基因集的表达进行比较。
作者:Bjarne Johannessen, Anita Sveen和Rolf I. Skotheim
维护者:Bjarne Johannessen
引文(从R内，输入引用(“锡”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TIN”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“锡”)
| R脚本 | TIN封装介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,ExonArray,GeneExpression,遗传学,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 2.12.0)，data.table,嫁祸于,aroma.affymetrix |
| 进口 | WGCNA,南瓜,stringr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,aroma.light,affxparser,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | TIN_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TIN_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | TIN_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TIN |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TIN/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
