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Bioconductor版本:释放(3.5)
靶捕获实验将基于杂交的(在溶液或微阵列中)捕获和富集基因组区域(例如exome)的捕获和富集,具有捕获的DNA片段的高通量测序。该包提供了评估和可视化目标浓缩过程质量的功能,如捕获,每目标读取覆盖等特异性和敏感性等等。
作者:M. Hummel,S.Bonnin,E.Lowy,G. Roma
维护者:Manuela Hummel
引文(从R内,输入引文(“TEQC”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“TEQC”)
PDF. | r script. | TEQC. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 遗传学那微阵列那QualityControl.那测序那软件 |
版本 | 3.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.8(R-2.13)(6.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | 方法,生物根系(> = 0.1.0),绞喉(> = 1.13.5),RSAMTOOLS.那HWRITER. |
进口 | BioBase.(> = 2.15.1) |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | teqc_3.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | teqc_3.16.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | teqc_3.16.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/teqc. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/teqc/ |
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