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TEQC.

DOI:10.18129 / b9.bioc.teqc.

目标捕获实验的质量控制

Bioconductor版本:释放(3.5)

靶捕获实验将基于杂交的(在溶液或微阵列中)捕获和富集基因组区域(例如exome)的捕获和富集,具有捕获的DNA片段的高通量测序。该包提供了评估和可视化目标浓缩过程质量的功能,如捕获,每目标读取覆盖等特异性和敏感性等等。

作者:M. Hummel,S.Bonnin,E.Lowy,G. Roma

维护者:Manuela Hummel

引文(从R内,输入引文(“TEQC”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“TEQC”)

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BROWSEVIGNETTES(“TEQC”)

PDF. r script. TEQC.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 遗传学微阵列QualityControl.测序软件
版本 3.16.0
在生物导体中以来 BIOC 2.8(R-2.13)(6.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 方法,生物根系(> = 0.1.0),绞喉(> = 1.13.5),RSAMTOOLS.HWRITER.
进口 BioBase.(> = 2.15.1)
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源包 teqc_3.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 teqc_3.16.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) teqc_3.16.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/teqc.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/teqc/
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