安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“TCGAbiolinks”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
TCGAbiolinks的目的是:我)环球数码创意开放获取数据检索方便,2)使用适当的准备数据预处理策略,3)提供的方法进行不同标准的分析和iv)很容易繁殖早期的研究结果。详细,包提供了多种方法进行分析(如微分表达式的分析,识别差异甲基化区域)和可视化的方法(例如,生存的阴谋,火山情节,亮光情节)为了方便开发完整的分析管道。
作者:安东尼奥Colaprico蒂亚戈Chedraoui Silva Catharina奥尔森,卢西亚诺Garofano,大卫。Garolini,克劳迪娅静脉,泰国人Sabedot, Tathiane马耳他、斯特凡诺·m·Pagnotta伊莎贝拉Castiglioni米歇尔,切Houtan Noushmehr蒋禄卡波特米
维护人员:安东尼奥Colaprico <安东尼奥。colaprico ulb.ac。>,蒂亚戈Chedraoui席尔瓦< tiagochst在usp.br >
从内部引用(R,回车引用(“TCGAbiolinks”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“TCGAbiolinks”)
HTML | R脚本 | 1。介绍 |
HTML | R脚本 | 2。环球数码创意数据库搜索 |
HTML | R脚本 | 3所示。下载和准备文件进行分析 |
HTML | R脚本 | 4所示。临床数据 |
HTML | R脚本 | 5。突变的数据 |
HTML | R脚本 | 使用TCGAbiolinks包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | TCGAbiolinks_2.5.9.tar.gz |
Windows二进制 | TCGAbiolinks_2.5.9.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | TCGAbiolinks_2.5.9.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCGAbiolinks |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TCGAbiolinks/ |
包下载报告 | 下载数据 |