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在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
SomaticSignatures
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DOI:10.18129 / B9.bioc.SomaticSignatures
体细胞签名
Bioconductor版本:Release (3.5)
SomaticSignatures包识别单核苷酸变异(snv)的突变签名。它提供了与Nik-Zainal (2012, Cell)中描述的方法相关的基础设施，具有矩阵分解算法的灵活性。
作者:Julian Gehring
维护者:Julian Gehring
引用(从R中，输入引用(“SomaticSignatures”))：
安装
要安装这个包，开始R，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("SomaticSignatures")
文档
| 超文本标记语言 | R脚本 | SomaticSignatures |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类,GenomicVariation,测序,软件,SomaticMutation,StatisticalMethod,可视化 |
| 版本 | 2.12.1 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.1.0)，VariantAnnotation,GenomicRanges,NMF |
| 进口 | S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,Biostrings,ggplot2,ggbio,reshape2,NMF,pcaMethods,Biobase、方法、代理 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,knitr平行,BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5,SomaticCancerAlterations,ggdendro,fastICA,股东价值分析 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/juliangehring/SomaticSignatures |
| BugReports | https://support.bioconductor.org |
| 全靠我 | |
| 进口我 | Rariant,YAPSA |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | SomaticSignatures_2.12.1.tar.gz |
| Windows二进制 | SomaticSignatures_2.12.1.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SomaticSignatures_2.12.1.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/SomaticSignatures |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SomaticSignatures/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
