要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqVarTools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SeqVarTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools

用于不同数据的工具

Bioconductor版本:Release (3.5)

SeqArray中提供的VCF数据快速访问存储格式的接口,以及用于常见操作和分析的工具。

作者:Stephanie M. Gogarten,郑秀文,Adrienne Stilp

维护者:Stephanie M. Gogarten , Zheng Xiuwen , Adrienne Stilp

引文(从R内,输入引用(“SeqVarTools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqVarTools”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SeqVarTools”)

PDF R脚本 SeqVarTools简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneticVariability遗传学单核苷酸多态性测序软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证 GPL-3
取决于 SeqArray(> = 1.11.17)
进口 grDevices,图形,统计,方法,stringrgdsfmtGenomicRangesIRangesS4VectorsGWASExactHWVariantAnnotationBiobaselogistf
链接
建议 BiocGenericsBiocStyleRUnit
SystemRequirements
增强了
URL
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进口我 《创世纪》
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SeqVarTools_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 SeqVarTools_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SeqVarTools_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/
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