要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqVarTools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
SeqArray中提供的VCF数据快速访问存储格式的接口,以及用于常见操作和分析的工具。
作者:Stephanie M. Gogarten,郑秀文,Adrienne Stilp
维护者:Stephanie M. Gogarten
引文(从R内,输入引用(“SeqVarTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqVarTools”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SeqVarTools”)
R脚本 | SeqVarTools简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(4年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | SeqArray(> = 1.11.17) |
进口 | grDevices,图形,统计,方法,stringr,gdsfmt,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,GWASExactHW,VariantAnnotation,Biobase,logistf |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,BiocStyle,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | 《创世纪》 |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SeqVarTools_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | SeqVarTools_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SeqVarTools_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |