安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
函数绘图SNP数组数据;维护由于历史原因
作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhu.edu >和Ingo Ruczinski
维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“SNPchip”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SNPchip”)
R脚本 | 绘制染色体组型 | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 2.22.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.0 (r - 2.5)(10.5年) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.14.0) |
进口 | 方法、图形晶格、网格foreach跑龙套,Biobase,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,SummarizedExperiment,oligoClasses(> = 1.31.1) |
链接 | |
建议 | crlmm(> = 1.17.14),RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | doSNOW,VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer |
URL | http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html |
取决于我 | mBPCR |
进口我 | crlmm,phenoTest |
建议我 | 类别,MinimumDistance,oligoClasses,VanillaICE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | SNPchip_2.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | SNPchip_2.22.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | SNPchip_2.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SNPchip |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/ |
包下载报告 | 下载数据 |