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DOI:10.18129 / B9.bioc.SIMAT

GC-SIM-MS数据处理和分析工具

Bioconductor版本:Release (3.5)

该软件包提供了一个管道，用于分析在选定离子监测(SIM)模式下采集的GC-MS数据。该工具还通过使用优化算法为感兴趣的目标选择适当的片段提供了指导。这是通过考虑用户提供的库中的重叠峰值来实现的。

作者:Mo R. Nezami Ranjbar

维护者:Mo R. Nezami Ranjbar

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SIMAT”)

PDF	R脚本	SIMAT用法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4.0)，Rcpp(> = 0.11.3)
进口	mzR，ggplot2、网格reshape2
链接
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	http://omics.georgetown.edu/SIMAT.html
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SIMAT_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	SIMAT_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SIMAT_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SIMAT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SIMAT/
软件包下载报告	下载数据