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Sepa

doi:10.18129/b9.bioc.sepa

Sepa

生物导体版本:版本(3.5)

给定单细胞RNA-seq数据和细胞或伪时间单元顺序的真实实验时间,SEPA为用户提供了方便的功能,使用户将基因分配为不同的基因表达模式,例如恒定,单调增加和增加,然后减少。然后,SEPA进行富集分析以分析具有相同或相似模式的基因的功能作用。

作者:Zhicheng ji,洪凯吉

维护者:zhicheng ji

引用(从r内,输入引用(“ sepa”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 SEPA:单细胞基因表达模式分析
PDF 参考手册

细节

生物浏览 ,,,,GUI,,,,基因表达,,,,软件,,,,可视化
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.10.0)
进口 GGPLOT2,,,,闪亮的,,,,topgo,,,,分段,,,,RESHAPE2,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db
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源包 sepa_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 sepa_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) sepa_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sepa
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/sepa/
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