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生物导体版本:版本(3.5)
给定单细胞RNA-seq数据和细胞或伪时间单元顺序的真实实验时间,SEPA为用户提供了方便的功能,使用户将基因分配为不同的基因表达模式,例如恒定,单调增加和增加,然后减少。然后,SEPA进行富集分析以分析具有相同或相似模式的基因的功能作用。
作者:Zhicheng ji,洪凯吉
维护者:zhicheng ji
引用(从r内,输入引用(“ sepa”)
):
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browsevignettes(“ sepa”)
R脚本 | SEPA:单细胞基因表达模式分析 | |
参考手册 |
生物浏览 | 去,,,,GUI,,,,基因表达,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(2年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.10.0) |
进口 | GGPLOT2,,,,闪亮的,,,,topgo,,,,分段,,,,RESHAPE2,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | sepa_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | sepa_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | sepa_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sepa |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sepa/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |