要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ reactionomepa”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
该软件包为基于Reactome Pathway数据库的途径分析提供了功能。它实现了富集分析,基因集富集分析和可视化的几种函数。
作者:广琴Yu [AUT,CRE],Vladislav Petyuk [CTB]
维护者:gmail.com> guangchuang yu
引用(从r内,输入引用(“ reactomepa”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ reactionomepa”)
html | R脚本 | R反应途径分析的R包装 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基因烯,,,,多重组合,,,,途径,,,,Reactome,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.20.2 |
在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(5。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.3.1),剂量(> = 3.0.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,Reactome.db,,,,Igraph,,,,石墨 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,clusterProfiler,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://guangchuangyu.github.io/reactomepa |
BugReports | https://github.com/guangchuangyu/reactomepa/issues |
取决于我 | |
进口我 | 生物加工者,,,,林 |
建议我 | Chipseeker,,,,Cindex,,,,clusterProfiler |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | reactomepa_1.20.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | reactomepa_1.20.2.2.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ReactOMEPA_1.20.2.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/reactomepa |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/reactomepa/ |
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