要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ reactionomepa”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Reactomepa

doi:10.18129/b9.bioc.reaeactomepa

Reactome途径分析

生物导体版本:版本(3.5)

该软件包为基于Reactome Pathway数据库的途径分析提供了功能。它实现了富集分析,基因集富集分析和可视化的几种函数。

作者:广琴Yu [AUT,CRE],Vladislav Petyuk [CTB]

维护者:gmail.com> guangchuang yu

引用(从r内,输入引用(“ reactomepa”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ reactionomepa”)

文档

html R脚本 R反应途径分析的R包装
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基因烯,,,,多重组合,,,,途径,,,,Reactome,,,,软件,,,,可视化
版本 1.20.2
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(5。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3.1),剂量(> = 3.0.0)
进口 AnnotationDbi,,,,Reactome.db,,,,Igraph,,,,石墨
链接
建议 生物使用,,,,clusterProfiler,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,测试
系统要求
增强
URL https://guangchuangyu.github.io/reactomepa
BugReports https://github.com/guangchuangyu/reactomepa/issues
取决于我
进口我 生物加工者,,,,
建议我 Chipseeker,,,,Cindex,,,,clusterProfiler
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 reactomepa_1.20.2.2.tar.gz
Windows二进制 reactomepa_1.20.2.2.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ReactOMEPA_1.20.2.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/reactomepa
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/reactomepa/
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