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DOI:10.18129 / B9.bioc.R453Plus1Toolbox

用于从罗氏基因组测序系统导入和分析数据的软件包

Bioconductor版本:Release (3.5)

R453Plus1工具箱包括用于分析罗氏454测序平台生成的数据的有用功能。它增加了质量保证功能以及检测到的变体的注释和可视化功能，补充了罗氏提供的软件工具及其产品。此外，还提供了检测结构变异的管道。

作者:Hans-Ulrich Klein, Christoph Bartenhagen, Christian Ruckert

维护人员:Hans-Ulrich Klein

安装

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文档

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PDF	R脚本	用于从罗氏基因组测序系统导入和分析数据的软件包
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，基础设施，质量控制，ReportWriting，测序，软件，可视化
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(7年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(>= 2.12.0)，方法，VariantAnnotation，Biostrings，Biobase
进口	utils, grDevices，图形，统计，工具，xtable，R2HTML，TeachingDemos，BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，XVector，GenomicRanges，SummarizedExperiment，biomaRt，BSgenome，Rsamtools，ShortRead
链接
建议	rtracklayer，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	R453Plus1Toolbox_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	R453Plus1Toolbox_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	R453Plus1Toolbox_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R453Plus1Toolbox
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/R453Plus1Toolbox/
软件包下载报告	下载数据