要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
这个包为短读的量化和分析提供了一个框架。它涵盖了一个完整的工作流程,从原始序列读取,比对和质量控制图的创建,到感兴趣的基因组区域的量化。
作者:Anita Lerch, Dimos Gaiditzis和Michael Stadler
维护者:Michael Stadler < Michael。斯塔德勒在fmi.ch>
引文(从R内,输入引用(“QuasR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“QuasR”)
R脚本 | 类星体简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,ChIPSeq,报道,遗传学,MethylSeq,预处理,质量控制,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(4.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | 平行,GenomicRanges(> = 1.13.3),Rbowtie |
进口 | 方法,grDevices,图形,utils,zlibbioc,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,BiocInstaller,Biobase,Biostrings,BSgenome,Rsamtools(> = 1.19.38),GenomicFeatures(> = 1.17.13),ShortRead(> = 1.19.1),GenomicAlignments,BiocParallel,GenomeInfoDb,rtracklayer,GenomicFiles |
链接 | Rsamtools |
建议 | Gviz,RUnit,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | QuasR_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | QuasR_1.16.0.zip(64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | QuasR_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QuasR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/QuasR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |