要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

QuasR

DOI:10.18129 / B9.bioc.QuasR

在R中量化和注释短读

Bioconductor版本:Release (3.5)

这个包为短读的量化和分析提供了一个框架。它涵盖了一个完整的工作流程,从原始序列读取,比对和质量控制图的创建,到感兴趣的基因组区域的量化。

作者:Anita Lerch, Dimos Gaiditzis和Michael Stadler

维护者:Michael Stadler < Michael。斯塔德勒在fmi.ch>

引文(从R内,输入引用(“QuasR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“QuasR”)

PDF R脚本 类星体简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐ChIPSeq报道遗传学MethylSeq预处理质量控制RNASeq测序软件
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(4.5年)
许可证 GPL-2
取决于 平行,GenomicRanges(> = 1.13.3),Rbowtie
进口 方法,grDevices,图形,utils,zlibbiocBiocGenericsS4Vectors(> = 0.9.25),IRangesBiocInstallerBiobaseBiostringsBSgenomeRsamtools(> = 1.19.38),GenomicFeatures(> = 1.17.13),ShortRead(> = 1.19.1),GenomicAlignmentsBiocParallelGenomeInfoDbrtracklayerGenomicFiles
链接 Rsamtools
建议 GvizRUnitBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 QuasR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 QuasR_1.16.0.zip(64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) QuasR_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QuasR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/QuasR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网