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DOI:10.18129 / B9.bioc.Pbase

操作和探索蛋白质和蛋白质组学数据

Bioconductor版本:版本(3.5)

一组类和函数的调查和理解蛋白质序列数据上下文中的蛋白质组学实验。

作者:Laurent与(aut)塞巴斯蒂安·吉布(aut (cre)

维护人员:塞巴斯蒂安·吉布<邮件在sebastiangibb.de >。劳伦与< lg390在cam.ac.uk >

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文档

HTML	R脚本	Pbase数据
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件,可视化
版本	0.16.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 2.10),方法,BiocGenerics,Rcpp,Gviz
进口	切肉刀(> = 1.3.6),Biobase,Biostrings,IRanges,S4Vectors,mzID,mzR(> = 1.99.1),MSnbase(> = 1.15.5),Pviz,biomaRt,GenomicRanges,rtracklayer,ensembldb(> = 1.99.13),BiocParallel,AnnotationFilter
链接
建议	testthat(> = 0.8),ggplot2,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,AnnotationHub,knitr,rmarkdown,BiocStyle,EnsDb.Hsapiens.v86(> = 2.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase
BugReports	https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Pbase_0.16.0.tar.gz
Windows二进制	Pbase_0.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	Pbase_0.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pbase
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Pbase/
包下载报告	下载数据