要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pathnet”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:释放(3.5)
PathNet使用途径中存在的拓扑信息和差异表达水平的基因(从微阵列实验获得),以鉴定在差异表达的背景下彼此显着富集的途径和2)。该算法描述于:PathNet:使用拓扑信息的通路分析工具。Dutta B,Wallqvist A和Reifman J.生物学和医学源代码2012年9月24日; 7(1):10。
作者:Bhaskar Dutta
维护者:Jason B. Smith
引文(从R内,输入引文(“pathnet”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“pathnet”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“pathnet”)
PDF. | r script. | pathnet. |
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | 不同的亚兴那ke那多匹匹莫森那网络那NetworkenRichment.那途径那软件 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.12(R-3.0)(4.5岁) |
执照 | GPL-3 |
依靠 | r(> = 1.14.0) |
进口 | |
链接到 | |
建议 | pathnetdata.那运行那生物根系 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | pathnet_1.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | pathnet_1.16.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | pathnet_1.16.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/pathnet. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/pathnet/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |