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PADOG

DOI:10.18129 / B9.bioc.PADOG

重叠基因的途径分析重量降低(PADOG)

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个方案实现了一套通用基因分析方法称为PADOG轻视基因的重要性往往横跨天际的基因进行分析。包还提供了一组基准基因分析方法的灵敏度和排名使用公共数据集从KEGGdzPathwaysGEO包24。

作者:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >;辉徐<辉。徐:gmail.com >

维护人员:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >

从内部引用(R,回车引用(“PADOG”)):

安装

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PDF R脚本 PADOG
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (r - 2.15)(5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.0.0),KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase
进口 limma,AnnotationDbi,GSA,foreach,doRNG,hgu133plus2.db,hgu133a.db,KEGG.db,nlme
链接
建议 doParallel、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 BLMA
进口我 EGSEA
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 PADOG_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 PADOG_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) PADOG_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PADOG/
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