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Organism.dplyr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Organism.dplyr
dplyr-based Bioconductor注释资源的访问
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包提供了一种替代方法接口Bioconductor“注释”资源,尤其是基因标识符映射“org”包的功能(例如,org.Hs.eg.db)和基因组的协调功能的TxDb包(例如,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene)。
作者:马丁•摩根(aut (cre) Yubo程(施)
维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“Organism.dplyr”)):
安装
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文档
| HTML | R脚本 | Organism.dplyr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,GenomeAnnotation,测序,软件 |
| 版本 | 1.2.2 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.4),dplyr(> = 0.7.0) |
| 进口 | RSQLite,S4Vectors,GenomeInfoDb,IRanges,GenomicRanges,GenomicFeatures,AnnotationDbi、方法、工具,跑龙套,BiocFileCache,dbplyr,DBI |
| 链接 | |
| 建议 | org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,org.Mm.eg.db,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
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| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
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| 源包 | Organism.dplyr_1.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | Organism.dplyr_1.2.2.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | Organism.dplyr_1.2.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Organism.dplyr |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Organism.dplyr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
