##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MutationalPatterns”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.MutationalPatterns

研究碱基替换目录中的模式

Bioconductor版本:Release (3.5)

一个广泛的工具集，用于表征和可视化碱基替换数据中的各种突变模式。

作者:Francis Blokzijl, Roel Janssen, Ruben van Boxtel, Edwin Cuppen

维护者:Francis Blokzijl ， Roel Janssen

安装

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文档

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PDF	R脚本	介绍MutationalPatterns
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学,软件,SomaticMutation
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (> = 3.3.0),GenomicRanges(> = 1.24.0),NMF(> = 0.20.6)
进口	统计数据,并行,BiocGenerics(> = 0.18.0),VariantAnnotation(> = 1.18.1),reshape2(> = 1.4.1),plyr(> = 1.8.3),ggplot2(> =魅惑,pracma(> = 1.8.8),SummarizedExperiment(> = 1.2.2),IRanges(> = 2.6.0),GenomeInfoDb(> = 1.8.1),Biostrings(> = 2.40.0),gridExtra(> = 2.2.1)
链接
建议	BSgenome(> = 1.40.0),BiocStyle(> = 2.0.3),biomaRt(> = 2.28.0),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19(> = 1.4.0),BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5(> = 0.99.1),TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene(> = 3.2.2)rtracklayer(> = 1.32.2),testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/UMCUgenetics/MutationalPatterns
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MutationalPatterns_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	MutationalPatterns_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MutationalPatterns_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MutationalPatterns
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MutationalPatterns/
包下载报告	下载数据