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DOI:10.18129 / B9.bioc.MineICA

分析ICA分解获得的基因组数据

Bioconductor版本:版本(3.5)

MineICA的目标是进行独立分量分析(ICA)在多个转录组数据集,将额外的数据(e。g分子、临床和病理)。这种综合ICA有助于组件通过研究它们的生物学解释与变量(e。g示例注释)和基因集,使组件的比较从不同的数据集使用correlation-based图。

作者:安妮Biton

维护人员:安妮Biton <安妮。在gmail.com biton >

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PDF	R脚本	MineICA:独立分量分析的基因组数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	MultipleComparison,软件,可视化
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase,plyr,ggplot2,尺度,foreach,xtable,biomaRt,gtools,GOstats,集群,marray,mclust,RColorBrewer,色彩,igraph,Rgraphviz,图,注释,Hmisc,fastICA,玉
进口	AnnotationDbi,光民,fpc,lumiHumanAll.db
链接
建议	biomaRt,GOstats,集群,hgu133a.db,mclust,igraph,breastCancerMAINZ,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,breastCancerVDX
SystemRequirements
增强了	doMC
URL
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MineICA_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	MineICA_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MineICA_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MineICA/
包下载报告	下载数据