# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MetaboSignal”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboSignal

MetaboSignal:基于网络的方法来覆盖和KEGG探索代谢和信号通路

Bioconductor版本:版本(3.5)

MetaboSignal是一个R包,允许合并、分析和定制KEGG代谢和信号通路。它是一种基于网络的方法来探测基因之间的拓扑关系(信号——或者enzymatic-genes)和代谢物,代表了一个强大的工具来调查代谢表型的遗传景观和监管网络。

作者:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >,Joram M. Posma , Ana L. Neves , Marc-Emmanuel Dumas

维护人员:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala < r。在imperial.ac.uk ayala14 >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MetaboSignal”)

文档

HTML	R脚本	MetaboSignal
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSignaling,GeneTarget,GraphAndNetwork,KEGG,网络,通路,Reactome,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3)
进口	KEGGgraph,mygene,hpar,org.Hs.eg.db,igraph,RCurl,biomaRt,KEGGREST,AnnotationDbi,MWASTools、统计数据、图形,跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaboSignal_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MetaboSignal_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MetaboSignal_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaboSignal
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboSignal/
包下载报告	下载数据