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DOI:10.18129 / B9.bioc.MaxContrastProjection

执行沿z维的3D图像到2D的最大对比度投影

Bioconductor版本:Release (3.5)

当记录3D荧光显微镜图像时，一个问题是如何正确地在2D中呈现这些结果。最大强度投影是一种常用的确定图像中每个像素焦平面的方法。然而，这种方法的问题是失焦元素仍然可见，使得边缘和精细结构难以检测。该包旨在通过使用给定像素周围的对比度来确定焦平面来解决这个问题，允许比其他方法更清晰的结构检测。为了方便起见，这个包还包含执行各种其他类型的投影的函数，包括最大强度投影。

作者:Jan Sauer, Bernd Fischer

维护人员:Jan Sauer < Jan。萨奥尔在dkfz-heidelberg.de >

安装

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文档

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browseVignettes(“MaxContrastProjection”)

PDF	R脚本	MaxContrastProjection
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,预处理,软件,可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	EBImage、统计数据、方法
链接
建议	knitr,BiocStyle,testthat
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MaxContrastProjection_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	MaxContrastProjection_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MaxContrastProjection_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MaxContrastProjection
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MaxContrastProjection/
包下载报告	下载数据