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MSstats
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats
蛋白质意义分析的DDA、SRM和DIA Label-free或基于标签的蛋白质组学实验
Bioconductor版本:版本(3.5)
一组工具,您相对蛋白质意义的统计分析,SRM和DIA实验。
作者:之一Meena崔(aut (cre),西里尔Galitzine (aut) Tsung-Heng蔡(aut),奥尔加Vitek (aut)
维护人员:之一Meena崔< mnchoi67 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“MSstats”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MSstats”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MSstats”)
| MSstats-manual.pdf | ||
| HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | MassSpectrometry,归一化,蛋白质组学,质量控制,软件,TimeCourse |
| 版本 | 3.8.6 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(4年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | Rcpp,lme4,marray,limma,gplots,ggplot2、方法、网格ggrepel,preprocessCore,MSnbase,reshape2,生存,minpack.lm跑龙套,grDevices、图形、统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://msstats.org |
| BugReports | https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MSstats_3.8.6.tar.gz |
| Windows二进制 | MSstats_3.8.6.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | MSstats_3.8.6.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
