要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“msnid”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:释放(3.5)
从mzidentml(利用MzID包)或文本文件中提取MS / MS ID数据。在从多个数据集中整理搜索结果后,它会评估其识别质量并优化过滤标准,以实现最大识别数,同时不超过指定的错误发现率。还包含许多公用事业公司来探索MS / MS结果,并评估错过和不规则的酶切割,质量测量精度等。
作者:Vlad Petyuk与劳伦特·戈托的贡献
维护者:Vlad Petyuk
引文(从R内,输入引文(“msnid”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“msnid”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“msnid”)
PDF. | r script. | 用于处理MS / MS标识的MSNID包 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 质谱那蛋白质组学那软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.0(R-3.1)(3年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.10),rcpp. |
进口 | msnbase.(> = 1.12.1),mzid.(> = 1.3.5),R.cache.那Foreach.那多达齐全,并行,方法,迭代器那data.table.那BioBase.那语言机构那重塑2.那dplyr.那MZR. |
链接到 | |
建议 | 生物焦那msmstests.那ggplot2.那运行那生物根系 |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 林葛普查组织 |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | msnid_1.10.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | msnid_1.10.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | msnid_1.10.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/msnid. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/msnid/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |