要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“msnid”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

msnid.

DOI:10.18129 / b9.bioc.msnid.

勘探和评估LC-MSN蛋白质组学识别型勘探和评估公用事业

Bioconductor版本:释放(3.5)

从mzidentml(利用MzID包)或文本文件中提取MS / MS ID数据。在从多个数据集中整理搜索结果后,它会评估其识别质量并优化过滤标准,以实现最大识别数,同时不超过指定的错误发现率。还包含许多公用事业公司来探索MS / MS结果,并​​评估错过和不规则的酶切割,质量测量精度等。

作者:Vlad Petyuk与劳伦特·戈托的贡献

维护者:Vlad Petyuk

引文(从R内,输入引文(“msnid”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“msnid”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“msnid”)

PDF. r script. 用于处理MS / MS标识的MSNID包
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 质谱蛋白质组学软件
版本 1.10.0
在生物导体中以来 BIOC 3.0(R-3.1)(3年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 2.10),rcpp.
进口 msnbase.(> = 1.12.1),mzid.(> = 1.3.5),R.cache.Foreach.多达齐全,并行,方法,迭代器data.table.BioBase.语言机构重塑2.dplyr.MZR.
链接到
建议 生物焦msmstests.ggplot2.运行生物根系
系统要求
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URL.
取决于我
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建议我 林葛普查组织
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包档案包

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源包 msnid_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件 msnid_1.10.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) msnid_1.10.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/msnid.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/msnid/
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