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Medips
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doi：10.18129/b9.bioc.medips
DNA IP-seq数据分析
生物导体版本：版本（3.5）
开发了MEDIP，用于分析源自甲基化DNA免疫沉淀（MEDIP）实验的数据，然后进行测序（MEDIP-SEQ）。但是，MEDIP提供了分析任何定量测序数据（例如chip-seq，mbd-seq，cms-seq等）的功能，包括计算样品组和饱和度和相关分析之间的差异覆盖率。
作者：Lukas Chavez，Matthias Lienhard，Joern Dietrich，Isaac Lopez Moyado
维护者：dkfz.de>的Lukas Chavez
引用（从r内，输入引用（“ MEDIPS”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Medips”）
| R脚本 | Medips | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，库务，，，，覆盖范围，，，，CPGISLAND，，，，DNAMETHYLATY，，，，差异性，，，，遗传学，，，，基因数，，，，微阵列，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，测序，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.7（R-2.12）（7年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0），BSGENOME，，，，rsamtools |
| 进口 | 基因组机，，，，生物弦，图形，gtools，，，，iranges，方法，统计，utils，EDGER，，，，DNACOPIGY，，，，Biomart，，，，rtracklayer，，，，预处理 |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，Medipsdata，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Medips_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Medips_1.28.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Medips_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/medips |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/medips/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
