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一顿饭

DOI:10.18129 / b9.bioc.mal.

进行甲基化分析

Bioconductor版本:释放(3.5)

包装以集成甲基化和表达数据。它还可以单独进行甲基化或表达分析。包括几种绘图功能以及基于冗余分析的新区域分析。SNP对区域的影响也可以估计。

作者:Carlos Ruiz-Arenas [Aut,Cre],Carles Hernandez-Ferrer [Aut],JuanR.González[Aut]

维护者:Carlos Ruiz-Arenas

引文(从R内,输入引文(“膳食”)):

安装

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文件

HTML. r script. 膳食简介
HTML. r script. 膳食案例示例
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 德甲基化微阵列软件Wholegenome.
版本 1.6.0
在生物导体中以来 BIOC 3.2(R-3.2)(2年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.2.0),BioBase.多atAdataset.
进口 Genomicranges.snpassoc.林马dmrcate.Snpstats.素食主义者生物根系Minfi.绞喉S4Vectors., 方法,多达齐全, 平行,ggplot2.(> = 2.0.0),SVA.换乘
链接到
建议 testthat.illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19.illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19knminfidata.mealdata.生物焦
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源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/meal.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/meal/
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