安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (mbt)
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Bioconductor版本:版本(3.5)
mbt方法由βt Baggerly et al(2003)的方法。相比baySeq(硬城堡和凯利2010年),DESeq(2010年安德斯和Huber)和准确的测试(罗宾逊2007年史密斯,2008)和麦卡锡et al(2012)的漠视,mbt高工作效率,也就是说,它具有高功率,高罗斯福的保守估计和高稳定性。mbt是西装——能够转录组数据,标记数据,SAGE数据(统计数据)小样本或几个复制库。它可以用来识别基因,信使rna亚型或标签两种情况之间的差异表达。
作者:Yuan-De谭
维护人员:Yuan-De Tan < tanyuande gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(mbt)
):
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browseVignettes (mbt)
R脚本 | 分析与“mbt”包RNA-Seq计数数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,MultipleComparison,圣人,测序,软件,转录 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(> = 3.3.0),统计数据,gplots,gtools、图形、基地,跑龙套,grDevices |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MBttest_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBttest_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | MBttest_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MBttest/ |
包下载报告 | 下载数据 |