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DOI:10.18129 / B9.bioc.IntEREst

Intron-Exon保留估计量

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个包对RNA-seq数据(执行Intron-Exon保留分析。bam文件)。

作者:阿里Oghabian <。Oghabian赫尔辛基。Fi >,达里奥·格列柯<达里奥。希腊在赫尔辛基。fi >, Mikko Frilander < Mikko。在helsinki.fi Frilander >

维护人员:阿里Oghabian <。Oghabian赫尔辛基。Fi >, Mikko Frilander < Mikko。在helsinki.fi Frilander >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	兴趣,内含子外显子保留估计量
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,AlternativeSplicing,报道,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,归一化,RNASeq,测序,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),GenomicRanges,Rsamtools,SummarizedExperiment,刨边机,S4Vectors
进口	seqLogo,Biostrings,GenomicFeatures,IRanges,seqinr,limma、图形、grDevices统计,跑龙套,网格,方法,DBI,RMySQL,GenomicAlignments,BiocParallel,BiocGenerics
链接
建议	clinfun,knitr,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IntEREst_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	IntEREst_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	IntEREst_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IntEREst
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IntEREst/
包下载报告	下载数据