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doi：10.18129/b9.bioc.ipo

XCMS数据处理参数的自动优化

生物导体版本：版本（3.5）

XCMS数据处理的结果在很大程度上取决于参数设置。IPO（`iSotopologue参数优化“）是一种参数优化工具，适用于不同种类的样品和液相色谱法与高分辨率质谱设备耦合，快速且无标记步骤。IPO使用天然稳定的13C同位素来计算峰采摘分数。通过最小化特征内的相对保留时间差异，通过最大化分组参数来优化保留时间校正，通过最大化特征的数量来优化分组参数的数量，从每次注入汇总样品的每次注射中恰好一个峰。通过设计实验可以实现不同的参数设置。使用响应表面模型评估所得的分数。

作者：gunnar libiseller ，Christoph Magnes ，Thomas Riebenbauer >

维护者：托马斯·里本鲍尔（Thomas Riebenbauer

安装

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文档

html	R脚本	IPO的XCMS参数优化
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	质谱，，，，代谢组学，，，，软件
版本	1.2.2
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（1年）
执照	GPL（> = 2） +文件许可证
要看	XCMS（> = 1.50.0），RSM，，，，相机，grdevices，图形，统计，utils
进口	生物比较
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，MSDATA，，，，mtbls2，，，，法阿科，，，，尼特
系统要求
增强	平行
URL	https://github.com/rietho/ipo
BugReports	https://github.com/rietho/ipo/issues/new
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ipo_1.2.2.2.tar.gz
Windows二进制	ipo_1.2.2.2.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	ipo_1.2.2.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ipo
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/ipo/
软件包下载报告	下载统计