要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ helloranges”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Helloranges

doi:10.18129/b9.bioc.helloranges

向BedTools用户介绍 *范围

生物导体版本:版本(3.5)

将BedTools命令行调用转换为R代码调用来自生物导体 *范围的基础架构。这旨在教育新手生物导体使用者,并比较两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔·劳伦斯

维护者:迈克尔·劳伦斯(Michael Lawrence)

引用(从r内,输入引用(“ Helloranges”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ helloranges”)

文档

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Browsevignettes(“ Helloranges”)

PDF R脚本 Helloranges教程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,基因数,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,变体
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(1年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 方法,生物基因,,,,S4VECTORS(> = 0.11.6),iranges(> = 2.7.11),基因组机(> = 1.27.1),生物弦(> = 2.41.3),BSGENOME,,,,GenomicFeatures,,,,变体(> = 1.19.3),rsamtools,,,,基因组签名,,,,rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfodB,,,,总结性特征
进口 docopt,统计,工具,utils
链接
建议 Hellorangesdata,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 helloranges_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 helloranges_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Helloranges_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/helloranges
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/helloranges/
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