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HTqPCR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.HTqPCR
高通量qPCR数据的自动化分析
Bioconductor版本:版本(3.5)
从高通量分析Ct值定量实时PCR (qPCR)化验跨多个条件或复制。输入数据可以从spatially-defined格式(ABI TaqMan低密度阵列或OpenArray;LightCycler罗氏应用科学;排名板从Bio-Rad实验室;传统的96或384孔板;或微流控设备,如动态数组Fluidigm公司。HTqPCR处理数据加载、质量评估、标准化、可视化和参数或非参数测试的统计学意义的Ct值之间的特性(如基因、小分子核糖核酸)。
作者:海蒂Dvinge,保罗·伯顿
维护人员:海蒂Dvinge < hdvinge fredhutch.org >
从内部引用(R,回车引用(“HTqPCR”)):
安装
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browseVignettes (“HTqPCR”)
| R脚本 | qPCR分析R | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MicrotitrePlateAssay,MultipleComparison,预处理,质量控制,软件,可视化,qPCR |
| 版本 | 1.30.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(8年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | Biobase,RColorBrewer,limma |
| 进口 | affy,Biobase,gplots、图形、grDeviceslimma、方法、RColorBrewer、统计、stats4跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | statmod |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.ebi.ac.uk/bertone/software |
| 取决于我 | |
| 进口我 | nondetects,unifiedWMWqPCR |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | HTqPCR_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HTqPCR_1.30.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | HTqPCR_1.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTqPCR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HTqPCR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
