要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ greylistchip”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
识别输入中具有高信号的芯片实验区域,这会导致峰值呼叫期间杂散的峰值。删除在峰值通话之前与这些区域保持一致的读取,以进行清洁芯片分析。
作者:Gord Brown
维护者:Gordon Brown
引用(从r内,输入引用(“ Greylistchip”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ greylistchip”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Greylistchip”)
R脚本 | 从输入库生成灰色列表 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,差异词,,,,基因数,,,,预处理,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.1),方法,基因组机 |
进口 | 基因组签名,,,,BSGENOME,,,,rsamtools,,,,rtracklayer,,,,大量的, 平行,GenomeInfodB,,,,总结性特征,统计,utils |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,生物基因,,,,运行 |
系统要求 | |
增强 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | GreylistChip_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | GreylistChip_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | GreylistChip_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/greylistchip |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/greylistchip/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |