# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GoogleGenomics”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.GoogleGenomics

R客户对谷歌基因组API

Bioconductor版本:版本(3.5)

提供了一个R包与Google基因组API进行交互。

作者:卡西娃娃(aut),妮可Deflaux (aut),悉达多Bagaria (aut (cre)

维护人员:悉达多Bagaria < sidb google.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GoogleGenomics”)

文档

HTML	R脚本	注释变体
HTML	R脚本	绘制平面图
HTML	R脚本	复制变异注释结果
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,遗传学,软件,ThirdPartyClient
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年)
许可证	Apache许可(= = 2.0)|文件许可
取决于	R (> = 3.1.0),GenomicAlignments(> = 1.0.1),VariantAnnotation
进口	Biostrings,GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges,httr,rjson,Rsamtools,S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase、方法
链接
建议	BiocStyle,httpuv,knitr,rmarkdown,testthat,ggbio,ggplot2,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://cloud.google.com/genomics/
BugReports	https://github.com/Bioconductor/GoogleGenomics/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GoogleGenomics_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	GoogleGenomics_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GoogleGenomics_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GoogleGenomics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GoogleGenomics/
包下载报告	下载数据