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Glimma
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Glimma
交互的HTML图形
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包为分析RNA-sequencing生成交互式可视化数据使用输出从limma,磨边机或者DESeq2包在一个HTML页面。的相互作用是建立在流行的静态表征的分析结果,以提供额外的信息。
作者:Shian苏、马修·e·里奇、慈善法律,斯图亚特·李
维护人员:Shian <苏苏。年代在wehi.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“Glimma”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Glimma”)
文档
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browseVignettes (“Glimma”)
| R脚本 | Glimma装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,微阵列,RNASeq,ReportWriting,测序,软件,可视化 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |文件许可 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0) |
| 进口 | Biobase,刨边机grDevices,jsonlite、方法、嘘统计数据,S4Vectors,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,DESeq2,limma,testthat,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Shians/Glimma |
| BugReports | https://github.com/Shians/Glimma/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Glimma_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Glimma_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | Glimma_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Glimma |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Glimma/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
