##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“Genomicfiles”）

DOI：10.18129 / b9.bioc.genomicfiles.

按文件或范围分发计算

Bioconductor版本：释放（3.5）

此程序包为并行计算分发“按文件”或“按范围”并行计算提供基础架构。用户定义的映射器和减速器功能为数据组合和操作提供了额外的灵活性。

作者：Bioconductor Package维护者[AUT，CRE]，Valerie Obenchain [Aut]，Michael Love [Aut]，Lori Shepherd [Aut]，Martin Morgan [Aut]

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“Genomicfiles”）

文件

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BROWSEVIGNETTES（“GenomicFiles”）

PDF.	r script.	基因组介绍
PDF.		参考手册
文本		消息
视频		从BAM文件读取 - 第2部分

细节

Biocviews.	覆盖范围那DataImport.那遗传学那基础设施那测序那软件
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（3.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.1.0），方法，生物根系（> = 0.11.2），Genomicranges.（> = 1.23.21），概括分析那生物相投（> = 1.1.0），RSAMTOOLS.（> = 1.17.29），rtracklayer.（> = 1.25.3）
进口	基因管理（> = 1.7.7），绞喉那S4Vectors.（> = 0.9.25），VariantAnnotation.那genomeinfodb.
链接到
建议	生物焦那运行那Genefilter.那Deepsnv.那rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14.那生物仪器那homo.sapiens.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我	cont那德内捷德那erma.那gqtlbase.那gqtlstats.那ldblock.那Quasr.那rqc.
建议我	MultiAsaySayexperiment.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	genomicfiles_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	genomicfiles_1.12.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genomicfiles.
包短网址	http://biocidodder.org/packages/genomicfiles/
包裹下载报告	下载统计信息