##尝试http：//如果不支持https：// url source（“https://biocumon.org/bioclite.r”）Bioclite（“Genomeinfodb”）

DOI：10.18129 / b9.bioc.genomeinfodb.

用于操作染色体和其他'seqname'标识符的实用程序

Bioconductor版本：释放（3.5）

包含数据和函数，用于定义和允许在不同染色体序列命名约定之间的转换（例如，“CHR1”与“1”）之间的转换，包括尝试在他们的自然而不是词典，而不是词典，订单中排放序列名称的函数。

作者:Sonali Arora, Martin Morgan, Marc Carlson, H. Pagès

维护者：Bioconductor Package维护者

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Browsevignettes（“Genomeinfodb”）

PDF.	r script.	Genomeinfodb：Genomeinfodb的简介
PDF.	r script.	Genomeinfodb：将您的生物提交给Genomeinfodb
PDF.		参考手册
文本		消息
视频		简单的任务Genomeinfodb.

细节

Biocviews.	注解那datarepresentation那遗传学那GenomeanNotation.那软件
版本	1.12.3
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（3.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.1），方法，生物根系（> = 0.13.8），S4Vectors.（> = 0.9.25），绞喉（> = 1.99.26）
进口	统计数据，stats4，utils，rcurl.那genomeinfodbdata.
链接到
建议	Genomicranges.那RSAMTOOLS.那基因管理那bsgenome.那基因组法那bsgenome.scerevisiae.ucsc.saccer2.那bsgenome.celegans.ucsc.CE2.那bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38.那txdb.dmelanogaster.ucsc.dm3.ensgene.ensgene.那运行那生物焦那kn
系统要求
加强
URL.
取决于我	bsgenome.那Bumphunter.那浮雕那法典那CSAR.那基因管理那基因组法那Genomicranges.那基因组那GMAPR.那GROHMM那Helloranges.那htseqtools.那德国兹那甲烷分析那RSAMTOOLS.那snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.那snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37.那Titancna.那VariantAnnotation.那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.
进口我	等位基因矛纪那高寒那Anufinder.那annotationhubdata.那annotatr.那Atacseqqc.那baalchip.那舞会礼服那Basicstarrseq.那Biovizbase.那Biseq.那bsgenome.那BSSeq.那卡斯珀那Cexor.那Chimeraviz那Chipenrich.那chipenrich.data.那chipexoqual.那Chippeakanno.那ChipSeeker.那铬星座那Cindex.那cn.mops.那克那CNPBAYES.那COMPETOOLS.那共识那骗子那撰稿人那Crisprvariants.那CSAW.那Customprodb.那德布勒那德内捷德那derfinderplot那Diffhic.那差异那easyrnaseq.那埃尔默那Ensembldb.那Ensemblvep.那Epigenomix.那Epivizrdata.那epivizrestalone.那eventPointer.那exoMecopy.那Funchip.那Funtoonorm.那Ga4ghclient.那GCAPC.那GenBankr.那基因测定那genogam.那基因组那GenomeIntervals.那基因组夫妇那基因组互动那基因组织那Genoset.那GenotyPeeval.那GGBIO.那GGTools.那GoogleGenomics.那gqtlstats.那Grasp2DB.那格雷比亚斯核糖那GUIDESEQ.那GVIZ.那Gwascat那H5VC那暖步那hit那htseqgenie.那IMAS.那inpas.那互动那IVAS.那Karyploter.那ldblock.那Madseq.那比赛那梅拉维兹尔那Methylkit.那甲基皮脂那弥撒那Minfi.那最小值那马赛克那MotifBreakr.那msgbsr.那mutationalpatterns.那myvariant那Nadfinder.那ringerpeaks.那诺考那有机族那PI.那Podkat.那预先那ProteomicsannotationHubData.那pur那QPGraph..那QSEA.那Quasr.那R3CPET.那r3cseq.那Rarevariantvis.那r那rcade.那RCA.那rcgh.那叙事那林那RegionReport.那repitools.那riboprofiling那Riboseqr.那rjmcmcncnucosomes.那怒吼那rtracklayer.那Semmentseq.那SEQARRAY.那seqplots.那SGSEQ.那缩短那SNPCHIP.那斯文那snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.那snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38.那snplocs.hsapiens.dbsnp149.grch38.那snplocs.hsapiens.dbsnp150.grch38.那Soggi.那Somaticsignatures.那拼接照片那碎片那斯坦那概括分析那tarseqqc.那tcgabiolinks.那TFBStools.那TrackViewer.那经纪人那Tsrchitect那TVTB.那香草那变型滤波器那Varianttools.那Wiggleplotr.那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38.那耶稣
建议我	annotationforge.那AnnotationHub那ExperimentHubData那gqtlbase.那QDNASEQ.那补偿
建立报告

包档案包

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源包	genomeinfodb_1.12.3.tar.gz.
Windows二进制文件	genomeinfodb_1.12.3.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	genomeinfodb_1.12.3.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genomeinfodb.
包短网址	http://biocidodder.org/packages/genomeinfodb/
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