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DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneGeneInteR

在基因水平测试基因-基因相互作用的工具

Bioconductor版本:Release (3.5)

本包的目的是提出在病例-对照关联研究中测试基因-基因相互作用的几种方法。这种测试可以通过聚合SNP-SNP相互作用测试在SNP水平(SSI)或通过使用基因-基因多维度方法(GGI)方法来完成。该软件包还提供了图形显示结果的工具。

作者:Mathieu Emily, Nicolas Sounac, Florian Kroell, Magalie Houee-Bigot

维护者:Mathieu Emily < Mathieu。emily at agrocampus-ouest.fr>， Magalie Houee-Bigot < Magalie。Houee at agrocampus-ouest.fr>

安装

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文档

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browseVignettes(“GeneGeneInteR”)

PDF	R脚本	GeneGeneInteR介绍
PDF	R脚本	成对交互测试
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability，遗传学，GenomeWideAssociation，单核苷酸多态性，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.3)
进口	snpStats，mvtnorm，GGtools，Rsamtools，igraph，kernlab，FactoMineR，plspm，IRanges，GenomicRanges，data.table，里奥哈葡萄酒， grDevices，图形，统计，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GeneGeneInteR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	GeneGeneInteR_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	GeneGeneInteR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneGeneInteR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneGeneInteR/
软件包下载报告	下载数据