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DOI:10.18129 / B9.bioc.GSEABase

基因集富集的数据结构和方法

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个包提供了类和方法支持基因集富集分析(GSEA)。

作者:马丁·摩根Seth猎鹰,罗伯特先生

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

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PDF	R脚本	介绍GSEABase
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,KEGG,软件
版本	1.38.2
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3)、方法图(> = 1.37.2)
进口	AnnotationDbi,XML
链接
建议	hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AGDEX,BicARE,CCPROMISE,cpvSNP,EnrichmentBrowser,gCMAP,GRridge,GSVAdata,npGSEA,承诺,splineTimeR
进口我	癌症,类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GISPA,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,MIGSA,mogsa,oppar,PCpheno,phenoTest,帖子,承诺,ReportingTools
建议我	BiocCaseStudies,BioCor,clusterProfiler,计,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSAR,GSEAlm,桅杆,PGSEA,phenoTest
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSEABase_1.38.2.tar.gz
Windows二进制	GSEABase_1.38.2.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GSEABase_1.38.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSEABase
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSEABase/
包下载报告	下载数据