要安装这个包，开始R，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOTHiC")
在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
哥特
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GOTHiC
Hi-C数据分析的二项检验
Bioconductor版本:Release (3.5)
这是一个Hi-C分析包，使用累积二项检验来检测远端基因组位点之间的相互作用，在Hi-C实验中，这些基因位点的读数明显多于预期。它将映射成对的NGS读取作为输入，并返回基因组中给定的仓大小的重要相互作用列表。
作者:Borbala Mifsud和Robert Sugar
维护人员:Borbala Mifsud
引用(从R中，输入引用(“哥特”))：
安装
要安装这个包，开始R，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GOTHiC")
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“哥特”)
| R脚本 | package_vignettes.pdf | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 表观遗传学，嗝，预处理，测序，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R(>= 2.15.1)，方法，utilsGenomicRanges，Biostrings，BSgenome，data.table |
| 进口 | BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.9.38),IRanges，Rsamtools，ShortRead，rtracklayer，ggplot2 |
| 链接 | |
| 建议 | HiCDataLymphoblast |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | HiCDataLymphoblast |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | GOTHiC_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GOTHiC_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | GOTHiC_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOTHiC |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOTHiC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
