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DOI:10.18129 / B9.bioc.GOSemSim

GO-terms语义相似性度量

Bioconductor版本:版本(3.5)

基因本体的语义比较(去)注释提供量化的方法来计算相似性的基因和基因群体,并成为许多重要基础生物信息学分析方法。GOSemSim是之间的语义相似度计算的R包去,套上,基因产品和集群。Schlicker GOSemSim蕾斯尼克提出的五个方法实现,分别江,林和王。

作者:Guangchuang Yu (aut (cre),阿列克谢Stukalov[所有],Chuanle肖(施)

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	介绍GOSemSim
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,去,网络,通路,软件
版本	2.2.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3.2)
进口	AnnotationDbi,GO.db、方法、跑龙套
链接	Rcpp
建议	AnnotationHub,BiocInstaller,clusterProfiler,剂量,knitr,org.Hs.eg.db,prettydoc,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://guangchuangyu.github.io/GOSemSim
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/GOSemSim/issues
取决于我	tRanslatome
进口我	BioMedR,clusterProfiler,剂量,网格,Rcpi
建议我	BioCor,epiNEM,SemDist
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GOSemSim_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	GOSemSim_2.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GOSemSim_2.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSemSim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/
包下载报告	下载数据