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DOI:10.18129 / B9.bioc.GEOsearch

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.5版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅GEOsearch。

GEOsearch

Bioconductor版本:版本(3.5)

GEOsearch是一个可扩展的搜索引擎NCBI地理(基因表达综合)。而不是直接搜索术语,GEOsearch可以找到所有的基因名称中包含搜索词和搜索所有基因的别名名称同时在地理数据库。GEOsearch还提供了其他功能,如总结常见的生物学关键字在搜索结果中。

作者:至诚,Hongkai霁

维护人员:至诚霁< zji4 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“GEOsearch”)

PDF	R脚本	基因表达综合GEOsearch:可扩展的搜索引擎
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.2)
进口	RCurl,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db
链接
建议	knitr,闪亮的,DT,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GEOsearch_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GEOsearch_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GEOsearch
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GEOsearch/
包下载报告	下载数据