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DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHclient

Bioconductor包访问GA4GH API数据服务器

Bioconductor版本:版本(3.5)

GA4GHclient提供了一种简便的方法来访问公共数据服务器通过基因组学和全球联盟卫生(GA4GH)基因组的API。它提供了低级访问GA4GH API和响应数据转换为Bioconductor-based类对象。

作者:Welliton Souza (aut (cre) Benilton卡瓦略(施),克莉斯婷罗查(施)

维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	GA4GHclient
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataRepresentation,软件,ThirdPartyClient
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	S4Vectors
进口	BiocGenerics,Biostrings,dplyr,GenomeInfoDb,GenomicRanges,httr,IRanges,jsonlite、方法、purrr,VariantAnnotation
链接
建议	AnnotationDbi,BiocStyle,DT,knitr,org.Hs.eg.db,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/labbcb/GA4GHclient
BugReports	https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GA4GHclient_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	GA4GHclient_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GA4GHclient_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHclient/
包下载报告	下载数据