安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“FlowSOM”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
FlowSOM提供了可视化选项对于血细胞计数数据,利用自组织映射聚类和最小生成树。
作者:苏菲·范·Gassen Britt Callebaut和Yvan Saeys
维修工:苏菲Van Gassen <苏菲。在ugent.be vangassen >
从内部引用(R,回车引用(“FlowSOM”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“FlowSOM”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“FlowSOM”)
R脚本 | FlowSOM | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FlowCytometry,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.2),igraph |
进口 | flowCore,ConsensusClusterPlus,BiocGenerics,tsne,XML,flowUtils |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be |
取决于我 | |
进口我 | cytofkit |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | FlowSOM_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | FlowSOM_1.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | FlowSOM_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSOM |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FlowSOM/ |
包下载报告 | 下载数据 |