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FlowSOM

DOI:10.18129 / B9.bioc.FlowSOM

使用自组织映射为可视化和血细胞计数数据的解释

Bioconductor版本:版本(3.5)

FlowSOM提供了可视化选项对于血细胞计数数据,利用自组织映射聚类和最小生成树。

作者:苏菲·范·Gassen Britt Callebaut和Yvan Saeys

维修工:苏菲Van Gassen <苏菲。在ugent.be vangassen >

从内部引用(R,回车引用(“FlowSOM”)):

安装

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PDF R脚本 FlowSOM
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssays,CellBiology,聚类,FlowCytometry,软件,可视化
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(2.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.2),igraph
进口 flowCore,ConsensusClusterPlus,BiocGenerics,tsne,XML,flowUtils
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://www.r-project.orghttp://dambi.ugent.be
取决于我
进口我 cytofkit
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 FlowSOM_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 FlowSOM_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) FlowSOM_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FlowSOM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/FlowSOM/
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